DiR'; DiIC₁₈(7)（1,1'-双十八烷基-3,3,3',3'-四甲基吲哚三碳菁碘）

如果您选择的示踪剂是亲脂性染料并且用甲醇固定，脂质会随着甲醇流失。如果您使用甲醇固定，可以选择能够共价结合神经元内的蛋白质的示踪剂。

由于这些染料插入脂质膜，任何对膜的破坏都将导致染料流失。这包括用Triton X-100之类的去垢剂或是甲醇之类的有机溶剂通透。通透是胞内抗体标记所必需的，但它会导致染料流失。相反，CFDA SE之类活性染料能够共价连接到细胞组分，因此可以在固定和通透之后更好的保留。

DiI是一种亲脂性染料，多数保留在细胞脂质内。当细胞经去垢剂通透或是用乙醇固定时，会去除掉脂质和染料。如果需要通透，可以使用CM-DiI标记，因为CM-DiI会共价结合膜里面的蛋白；部分信号会随着固定/通透丢失，但残留的信号仍足以被检测出。

转运过程相当缓慢：在活体组织中大约6 mm/天，在固定组织中更慢。亲脂性羰花青示踪剂从开始给样处扩散到神经元末端，可能需要数天甚至数周的时间。FAST DIO和DiI类似物（具有不饱和烷基尾）可以提高50％左右的转运速度。

请选择与您现有的激发光源和发射滤光片组/通道兼容的染料。固体、糊和晶体形式的染料可直接施加到组织中的神经元。如需标记培养的细胞或进行显微注射，可采用溶液或固态形式的亲脂性染料。