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SeqStudio 基因分析仪

简单、快速、低通量的 Sanger 测序与片段分析系统

Applied Biosystems SeqStudio 基因分析仪是一款低通量、易于使用且便捷的台式系统，提供金标准的 Sanger 测序技术和基于毛细管电泳的片段分析，只需轻点即可完成。 只需装载样品，将创新的一体化试剂盒卡入设备并启动即可。

 

SeqStudio基因分析仪在广泛的应用中均易于使用，包括从头测序、靶向测序、质粒 Sanger 测序、CRISPR-Cas9 基因组编辑验证、细胞系鉴定以及单核苷酸多态性（SNP）检测。仪器设置简单，几分钟内即可准备就绪。SeqStudio 基因分析仪以实惠的价格提供卓越的数据质量、易用性、服务与支持。

 

需要更高通量？与 SeqStudio 仪器类似，我们的 SeqStudio Flex 基因分析仪也是一款易于使用、灵活的 Sanger 测序和片段分析系统，但具有更高的通量。

SeqStudio 3D 导览

特点

SeqStudio 基因分析仪旨在为需要简便且经济的 Sanger 测序和片段分析的新手与有经验用户提供解决方案，同时不牺牲性能或质量。

创新一体式卡夹

只需装入样品、插入试剂卡夹并开始运行——无需专业技术人员进行安装或维护。

快速周转

最短仅需 30 分钟即可完成一次运行。

优化的端到端工作流程

单一聚合物体系允许桑格测序和片段分析样品在同一板上、同一工作流程中运行，无需重新配置。

触控屏易用性

直观的触控屏界面简化了板、样品和运行设置，并可选择多种格式显示结果。

与 Thermo Fisher Connect 的连接性

通过赛默飞云端平台 Thermo Fisher Connect，随时随地管理您的运行。

综合分析软件

一级和二级分析软件模块可供下载，或通过 Thermo Fisher Connect 获取。

可追溯性与数据安全模块

可选的安全、审计与电子签名（SAE）软件模块提供电子数据监管链，以帮助确保存储数据的完整性。

SmartStart 客户入门培训

每台 SeqStudio 仪器的购买均包含为期一天的现场 SmartStart 入门培训课程，帮助您快速上手并投入运行。

了解这些功能的更多信息：

SeqStudio 基因分析仪使用创新的一体式卡夹，该卡夹包含毛细管阵列、阳极缓冲液和一个含有用于测序和片段分析的聚合物的储液槽。 将样品装载、插入卡夹，即可开始——无需专家设置或维护、无需每次运行前校准，也无需安装单独组件。 卡夹上的试剂在仪器内可稳定保存4–6个月，具体时长取决于产物的反应规模。

 

单个卡夹可指定用于不同的实验设计或不同的研究人员，从而使多位用户能够共用一台 SeqStudio 基因分析仪。该卡夹系统让您仅按需使用，避免不必要的浪费，同时无需共用实验试剂。卡夹还可回收利用。*

 

*卡夹回收仅在特定地区提供。详情请访问： thermofisher.com/seqstudiorecycling.

集成一体化卡夹设计。

该卡夹包含四根毛细管、一个检测器以及用于输送聚合物和缓冲液的泵送系统。

集成的交互式触摸屏可帮助您设置板和样品、创建或修改运行模块、调整运行模块优先级，并启动与管理运行。 以多种格式查看结果，包括列表视图、微孔板视图以及测序曲线或电泳峰图。 多种视图可帮助提高对实验数据的信心。

 SeqStudio 数据采集软件包含一个可选的安全、审计与电子签名 (SAE) 模块，该模块提供电子数据保全链。 SAE 模块通过为每个用户账户定义安全设置、对数据对象进行全面审计以及对更改要求身份验证，来帮助确保数据完整性。 所有设置均可自定义，以满足您实验室的需求。

 

SAE 模块支持以符合 US 食品和药物管理局《电子记录与电子签名规则》（《联邦法规》第21编第11部分，21 CFR Part 11）的方式进行电子记录保存。 要实现 21 CFR Part 11 的合规，您的机构还需以合规方式建立并记录标准操作程序（SOP）。

 

SAE 应用需要一台通过赛默飞购买的独立计算机（可提供台式机或笔记本版本），并且必须由现场服务工程师在现场启用。*

 

 *如果启用可选的 SAE 软件模块，则云连接将被禁用，远程访问不可用。

应用

Sanger 测序是测序技术的金标准，具有高准确性、可进行长片段测序的能力，并能灵活支持众多研究领域的多样化应用。 同样，DNA 片段分析可实现多种应用，从基因分型到细菌鉴定，以及从植物筛查到基因表达谱分析。

 

以下为可在 SeqStudio 基因分析仪上运行的应用示例。有关更多应用信息，请参阅我们的 SeqStudio 应用页面。

 

从头 Sanger 测序

靶向 Sanger 测序

质粒测序

肿瘤学研究

微生物物种鉴定

下一代测序 (NGS) 确认

CRISPR-Cas9 基因编辑分析

人源细胞系鉴定

单核苷酸多态性（SNP）分型

人类拷贝数变异 (CNV) 分析

DNA 甲基化分析

低丰度体细胞变异检测与分析

微卫星不稳定性（MSI）分析

Repeat DNA 扩增

SARS-CoV-2 鉴定

 

了解有关这些应用的更多信息：

在 CRISPR-Cas9（或 TALEN）基因组编辑工作流程中，有两个环节需要对编辑结果进行验证。 首先，在初始编辑程序之后，对所得混合培养物进行初筛可以确定含有编辑的细胞百分比（编辑效率）。 如果编辑后的细胞随后被纯化或亚克隆化，二次筛选可帮助确保亚克隆群体中的所有细胞均含有该编辑。 使用 SeqStudio基因分析仪进行 Sanger 测序可完成这两项筛查，作为赛默飞端到端基因组编辑工具和试剂产品组合的一部分。

 

在下图所示的原筛选中，从经编辑以在 HPRT 或 relA 基因座目标位点周围引入随机缺失的 HEK293 细胞中获得了全细胞裂解物。 为确认编辑位置，对编辑后的细胞在 SeqStudio基因分析仪上进行测序，随后将 Sanger 测序痕迹上传至云端并使用 Sanger Variant Analysis 模块进行分析。 在显示 HPRT 基因座的筛选图像中，编辑位置被清楚标示，可通过断点下游大量的混合碱基峰进行可视化。

使用 SeqStudio基因分析仪对 HPRT 基因座的基因组编辑样本进行 Sanger 测序分析。

在含有人类 HPRT 位点基因组编辑事件的混合细胞群中，使用基于云的 Sanger Variant Analysis 应用程序进行分析，该应用可识别在正向和反向序列中均出现的单核苷酸变异。 在右侧，痕迹分析能够检测到基因组切割事件发生的位置，产生的混合序列群可见于右侧小图中蓝色框的左侧。

虽然 Sanger Variant Analysis 能清楚显示断点和随机缺失，但无法计算整体的编辑效率。 为此，使用 Tracking of Indels by Decomposition (TIDE) 软件分析了 Sanger 测序痕迹文件，TIDE 是用于分析基因组编辑事件效率的广泛可用工具。 下方图表显示了各位点缺失类型及其频率。 这些频率结果证实了通过 Invitrogen TOPO 克隆并对相同编辑细胞群进行 Sanger 测序所得的结果。

使用 TIDE 软件对 HPRT 和 relA 位点的两种不同基因组编辑事件进行分析。 HPRT 和 relA 位点的事件使用 TIDE 软件进行分析，所用的混合群体测序痕迹由 SeqStudio基因分析仪 生成。 柱状图显示了在正向方向上具有指示数量核苷酸缺失或插入的群体比例（与反向方向几乎相同；数据未显示）。 对于 (A) HPRT，双向的总体编辑效率约为 80%；而在 (B) relA 位点的总体编辑效率约为 20%。

尽管人体疾病研究在很大程度上依赖于体外培养的离体人体细胞系，但体外培养的细胞可能被误认或被其他无关细胞系污染，以致资助机构和期刊现在在授予资助或批准发表之前要求进行细胞系鉴定（CLA）。 验证细胞系真实性的一种方法是使用 SeqStudio基因分析仪识别并比对其高度特异的短串联重复（STR）可变遗传“指纹”。

 

在此流程中，使用 IdentiFiler Plus 或 IdentiFiler Direct 试剂盒（分别用于纯化的 DNA 样本或粗制 DNA 样本）扩增 16 个高变异性人类 STR 位点，这些位点常用于验证细胞系真实性（亦用于法医鉴定）。 这些片段在 SeqStudio 仪器上使用 GeneMapper 或 Microsatellite Analysis 软件进行分析，以表征 IdentiFiler 试剂盒鉴定的等位基因，结果可用于查询 ATCC 或其他 STR 数据库以核实真实性。

细胞系鉴定的两种工作流程

 (A) 可将细胞点样到 NUCLEIC-CARD 装置上，取卡片打孔后使用 CLA IdentiFiler Direct 试剂盒直接扩增，并在 SeqStudio基因分析仪 上使用 GeneMapper Software 6 或 Microsatellite Analysis (MSA) 云应用对片段进行分析。 (B) 或者，可从细胞系中提取基因组 DNA（gDNA），使用 CLA IdentiFiler Plus 或 CLA GlobalFiler 试剂盒进行扩增，随后在 SeqStudio 仪器上用 GeneMapper Software 6 或 MSA 云应用分析片段。

在对 SeqStudio基因分析仪 检测污染细胞能力的测试中，一群 M4A4GFP 细胞被加入不同比例的 HeLa 细胞，并使用 IdentiFiler Direct 试剂盒（流程 B）进行分析。 即使 HeLa 细胞仅占总体的 10%，仍可检测到 HeLa 特异的等位基因。

基于 SeqStudio基因分析仪进行细胞系污染分析。

将 HeLa 细胞与 M4A4GFP 细胞悬液稀释至 5 × 10^5 个细胞/mL，按指示比例混合，并点样至 NUCLEIC-CARD 样本收集设备。 结果显示：在 SeqStudio 仪器上，当 HeLa 细胞占总体约 20% 时，即可以较高置信度（>80%）检测到污染；若其占比降至约 10%，仍可检测到某些 HeLa 特有的等位基因。

优化的端到端工作流程

SeqStudio基因分析仪可以在相同工作流程中于同一板上同时进行 Sanger 测序和片段分析。 通过消除样本成批处理的需求，可提升实验室排程的灵活性并更高效地利用时间。

双重工作流程。

SeqStudio基因分析仪可在同一板上同时执行 Sanger 测序和片段分析运行。

我们为 Sanger 测序和片段分析工作流程的每一步提供完整的产品组合。对于 Sanger 测序，这包括 DNA 模板扩增、PCR 纯化、循环测序、测序纯化、仪器上机耗材以及数据分析。对于片段分析，这包括 DNA 提取、PCR 扩增、仪器上机耗材以及数据分析。

视频、网络研讨会与演示

参数规格

属性

描述

毛细管数量

4

染料数量

6

样本格式

96 孔标准平板和标准 8 管条

应用
  • Sanger 测序（用于NGS确认的重新测序、插入/缺失变异（indels）、杂合子检测、低频变体检测、微生物鉴定、基因组编辑验证）
  • 片段分析（微卫星分析，兼容MLPA，适用于Applied Biosystems SNaPshot应用，细胞系鉴定

包含二级分析软件
  • 序列分析软件
  • SeqScape 软件
  • Variant Reporter 软件
  • GeneMapper 软件
  • Minor Variant Finder 软件
  • Sequencing Analysis Modules（Quality Check、Variant Analysis 和 NGS确认）在 Connect 平台上
  • 多重荧光片段分析 Modules（Peak Scanner 和 微卫星分析）在 Connect 平台上
  • SeqScreener Gene Editing 应用

保修

包含（1 年）

实验室应用培训

包含

属性

描述

毛细管阵列长度

28 cm（与 POP-1 聚合物配合使用，可解析短读和长读）

聚合物类型

通用型 polymer POP-1（用于执行测序和片段分析）

最大插入/反应次数

Up to 125次 插入/500 次反应或样品（A33671）

Up to 250次 插入/1000 次反应或样品（A41331）

仪器上保质期

开封后4或6个月

耗材卡夹回收

大多数地区可提供

仪器上跟踪

RFID（射频识别）

 

服务

为 SeqStudio基因分析仪提供卓越的服务与支持

选择适合您的服务计划。 通过我们的一项全面服务计划，可帮助最大化系统正常运行时间、降低维修成本和周转时间、延长仪器使用寿命，并保持其在最佳性能下运行。 从多种服务选项中选择，以平衡预算、生产力、运行时间和监管要求。 在为您的 SeqStudio基因分析仪 提供卓越服务与支持方面，我们为您提供支持。

 

SmartStart 引导培训助您成功

每台 SeqStudio 基因分析仪都包含为期一天的现场 SmartStart 引导培训，以便快速启动并投入运行。 由您所在地的现场应用科学家（FAS）主导，本次互动培训概述仪器操作与维护、数据采集与分析软件、云端连接、数据故障排查等内容。

 

综合保修与服务计划保护您的投资

SeqStudio 基因分析仪享有标准一年的出厂保修，保修范围包括必要的差旅、人工及零部件费用。 在购买仪器时可选择延长覆盖的服务计划。 通过预防性维护、主动的仪器监测以及我们优质服务计划所包含的快速响应时间，保持实验室平稳运行。

 

服务计划概览

服务内容

AB Maintenance（Plus）计划

AB Assurance 计划

现场响应时间

预期 2 个工作日*

担保 2 个工作日*

计划安排的现场维护

✓

✓

远程仪器诊断

✓

✓

零部件、人工与差旅

10% 折扣（仅限 US 地区）

✓

优先获取远程服务工程师支持

 

✓

再鉴定、计划性维护（PM）后的复检及重大维修

 

 

由现场应用科学家进行故障排除

 

 

*响应时间因地区而异

 

所有服务计划均包含定期计划性维护及最新软件更新，以实现最佳可靠性。 服务计划可帮助使运营成本更可预测，因为零件、人工和工程师差旅费已包含或享受折扣。

资质确认服务有助于确保符合监管要求

SeqStudio 基因分析仪的仪器硬件鉴定包括安装确认 (IQ)、运行确认 (OQ) 和仪器性能验证 (IPV) 服务。 我们的鉴定专家将与您合作，提供及时、具有成本效益且值得信赖的鉴定服务，包含可靠的审核式文档，以帮助确保您的 SeqStudio 基因分析仪符合监管要求。

资源

订购信息

仅供研究使用。不得用于诊断用途。