TUNEL(末端脱氧核苷酸转移酶dUTP缺口末端标记)检测是一种在分子生物学和细胞死亡研究领域广泛应用的技术。正在经历凋亡的细胞会表现出核形态的变化,包括DNA片段化、染色质浓缩、核膜降解、核皱缩以及DNA链断裂。Thermo Fisher Scientific提供的TUNEL检测能够帮助研究人员在组织样本或培养细胞中可视化并定量DNA片段化。此外,我们的检测方案设计兼容其他试剂和实验流程,便于检测更多细胞健康和活性参数。

什么是TUNEL检测?

在程序性细胞死亡(即凋亡)的晚期阶段,DNA会高度片段化。这种片段化为利用末端脱氧核苷酸转移酶dUTP缺口末端标记(TUNEL)反应将修饰的dUTP连接到受损DNA的3’-OH末端提供了机会。修饰的dUTP,如BrdUTP或EdUTP,可以通过多种不同的检测策略进行检测。针对BrdUTP的抗体可用于间接检测,而直接检测则可通过掺入生物素或荧光修饰的核苷酸(如生物素-dUTP或荧光素-dUTP)实现。dUTP的修饰形式EdUTP则通过“点击”化学反应为检测策略提供了更大的灵活性。TUNEL检测已成为检测凋亡的广泛应用的原位检测方法。


利用点击化学的TUNEL检测

Click-iT TUNEL 试剂盒

传统的 TUNEL 检测方法是通过将 BrdUTP 掺入 DNA 中,然后通过多种方式进行检测。Thermo Fisher Scientific 开发了一种改良的 TUNEL 检测方法,该方法利用末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)将炔基修饰的 dUTP(EdUTP,见图 1)掺入到断裂 DNA 的 3'-OH 末端。在 Invitrogen Click-iT TUNEL 检测中,对掺入的核苷酸的检测是通过点击化学实现的,这是一种基于铜催化叠氮-炔基环加成反应的方法,其高度特异性来源于叠氮和炔基反应对在生物分子、细胞、组织或模式生物中没有内源性存在。掺入的 EdUTP 可通过荧光或比色法进行检测。

Click-iT-EdUTP-structure-328x211

图 1. Click-iT TUNEL 成像检测试剂盒中提供的 Click-iT EdUTP 核苷酸结构。

Click-iT TUNEL 成像检测的基本步骤如图 2 所示。样本处理后,对细胞或组织进行固定和通透,以保存晚期凋亡细胞,从而减少因细胞脱落和随后的丢失而导致的假阴性结果的可能性。随后,EdUTP 核苷酸在 TdT 的作用下迅速掺入断裂的 DNA 中。下一步是连接染料或生物素叠氮,之后可选择性地加入复染剂。与采用一步法掺入染料或生物素修饰核苷酸的检测方法相比,Click-iT TUNEL 成像检测所采用的两步法,在相同条件下两小时内可检测到更高比例的凋亡细胞(见图 3)。

EdUTP 掺入 DNA 后连接染料或生物素叠氮分子,并加入可选复染剂

图2 使用 Click-iT TUNEL 成像检测检测细胞凋亡。EdUTP 由 TdT 掺入 DNA 后,连接染料或生物素叠氮,并可选择性加入复染剂。

柱状图显示使用Click-iT EdUTP衍生物检测到的阳性凋亡细胞比例最高

图3. 不同修饰型dUTP对检测到的凋亡细胞百分比的影响比较。HeLa细胞用0.5 μM的斯陶洛斯波林处理4小时。固定和透化后,按照厂家说明书分别使用Click-iT EdUTP、BrdUTP和两种不同的荧光素dUTP产品进行TUNEL成像检测。阳性百分比根据相应的阴性对照计算。成像和分析使用Thermo Fisher Scientific ArrayScan II进行。

Click-iT Plus TUNEL 检测

原始Click-iT TUNEL成像检测所涉及的检测化学反应依赖于铜的使用,我们发现生物分子对铜浓度表现出不同的敏感性。例如,用于催化点击化学反应的高铜浓度会影响与荧光蛋白(如GFP)多重检测的能力,因为蛋白的荧光会降低,或影响使用特异性结合肌动蛋白的化合物鬼笔环肽,其结合能力也会下降。为克服这些挑战,我们开发了Click-iT Plus TUNEL检测,将铜浓度优化,以在驱动检测反应的同时,保留荧光蛋白的信号并兼容鬼笔环肽的结合。

使用BrdU的TUNEL检测

APO-BrdU TUNEL检测是一种双色检测方法,用于标记DNA断裂和细胞总DNA,通过成像或流式细胞术检测凋亡细胞。Invitrogen APO-BrdU检测使用BrdU和TdT标记片段化DNA的3'-OH末端,类似于图2所述的TUNEL技术。随后使用Alexa Fluor 488标记的抗BrdU单克隆抗体检测BrdU。该检测还包括碘化丙啶,用于测定细胞总DNA含量,并提供固定的阳性和阴性对照细胞以评估检测性能。

Learn about 其他凋亡检测方法

 

TUNEL 组织检测TUNEL 培养细胞检测
Click-iT Plus TUNEL Assays for In Situ Apoptosis DetectionClick-iT TUNEL Colorimetric IHC Detection KitClick-iT TUNEL Alexa Fluor Imaging Assays for Microscopy and HCS
检测原理这些检测方法利用 EdUTP(一种经修饰的 dUTP,带有一个小的、生物正交的炔基部分),该物质会被 TdT 酶掺入到断裂 DNA 的 3’-OH 末端。
应用原位凋亡检测通过温和点击反应检测凋亡

样本类型

针对组织样本进行了优化,也可用于贴壁细胞

 

培养细胞 / 固定细胞
读出信号荧光比色法荧光

Label

Alexa Fluor 488Alexa Fluor 594Alexa Fluor 647BiotinAlexa Fluor 488Alexa Fluor 594Alexa Fluor 647
Ex/Em (nm)495/519590/615650/670N/A495/519590/615650/670
Standard filter setFITC filterTexas Red filterCy5 filterN/AFITC filterTexas Red filterCy5 filter
Instrument platformFluorescence imaging microscopy
High content analysis
Brightfield imaging microscopyImaging microscopy
High content analysis
兼容性可与GFP/鬼笔环肽多重标记可与苏木素/甲基绿多重标记使用标准荧光染料进行多重标记 不建议与荧光蛋白或鬼笔环肽进行多重标记
FixationRequired (mild fixation and permeabilization)

 

See all Click-iT Plus TUNEL AssaysC10625See all Click-iT TUNEL Alexa Fluor Assays


用于组织分析的TUNEL检测

Click-iT Plus TUNEL 荧光检测法

Invitrogen Click-iT Plus TUNEL 体内凋亡检测试剂盒已针对组织切片进行了优化,尽管也可用于贴壁细胞。该基于荧光的检测方法兼容GFP及其他荧光蛋白,并可与鬼笔环肽(phalloidin)进行多重标记,如图4所示。Click-iT Plus TUNEL 检测可产生明亮、光稳定的荧光信号,并可选用Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 594或Alexa Fluor 647叠氮试剂。

5 panel images of mouse intestinal muscle tissue section showing multiplex ability of TUNEL assay with other fluorescent probes

图4. Click-iT Plus TUNEL 检测可与多种其他荧光探针进行多重标记。来自表达GFP的小鼠肠道肌肉的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织经DNase I处理后, followed by the Click-iT Plus TUNEL Assay with Alexa Fluor 594 dye, and then stained with Hoechst 33342 dye and Alexa Fluor 647 Phalloidin. (A) 细胞核被Hoechst 33342染料(蓝色)染色,(B) 周围肌层检测到GFP信号(绿色),(C) 丝状肌动蛋白被Alexa Fluor 647鬼笔环肽(紫色)染色,(D) DNase I处理后由Click-iT Plus TUNEL检测和Alexa Fluor 594染料(红色)明确显示TUNEL阳性信号。最后一个面板(E)为四种荧光信号叠加后的多重标记图像。


Click-iT TUNEL 比色检测法

Invitrogen Click-iT TUNEL 比色IHC检测试剂盒已针对利用生物素叠氮和链霉亲和素-过氧化物酶偶联物在组织中识别凋亡细胞进行了优化,尽管也可用于贴壁细胞。在EdUTP掺入DNA断裂位点后(见图5),EdUTP被生物素叠氮标记。随后加入链霉亲和素-过氧化物酶和DAB(过氧化物酶底物)后,会产生可通过光学显微镜检测并可长期保存的深棕色信号。该检测还可与其他比色组织染色进行多重标记(见图6)。

EdUTP掺入DNA后连接生物素叠氮,链霉亲和素-过氧化物酶与生物素结合,并在加入DAB后显色的示意图

图5. Click-iT TUNEL 比色IHC检测试剂盒的实验流程. EdUTP掺入DNA后连接生物素叠氮,随后链霉亲和素-过氧化物酶与生物素结合,加入DAB后产生有色产物。
 

明场视野下的组织切片,棕色细胞核、粉色结缔组织和细胞质,以及蓝色非凋亡细胞核

图6. 小鼠组织切片使用比色Click-iT TUNEL凋亡检测法进行标记。取一张8微米的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)小鼠胸腺切片, 使用 Click-iT TUNEL Colorimetric IHC Detection Kit 进行DAB标记以显示凋亡细胞(深棕色细胞核)。 随后用伊红Y(粉色)染色组织,再用甲基绿(蓝色)对细胞核进行复染,脱水后用Thermo Scientific Cytoseal 60封片剂进行硬封片。明场图像通过EVOS FL Auto成像系统配备的彩色相机和20倍物镜采集。

培养细胞的TUNEL检测

Invitrogen Click-iT TUNEL Alexa Fluor成像检测盒已针对高内涵筛选(HCS)和显微镜下培养细胞成像进行了优化。其小巧且特异性的标记基团使实验流程快速高效。整个检测过程可在2小时内完成,并能高效区分群体中即使是高比例的凋亡细胞。Click-iT TUNEL检测可选择不同荧光标记,支持与表面及细胞内生物标志物的多重检测。对于细胞骨架检测,我们建议使用一抗而非鬼笔环肽(见图7)。同时,不建议与荧光蛋白联合使用。该检测已在HeLa、A549和CHO K1细胞中用多种诱导凋亡的试剂(包括斯陶洛斯波菌素)进行测试,并与基于抗体的其他凋亡标志物检测(如裂解的多聚ADP核糖聚合酶(PARP)、裂解的半胱天冬酶-3和磷化组蛋白2B)进行多重检测。此外,该方法也成功检测了通过siRNA敲低DEC2转录因子在人MCF-7乳腺癌细胞中诱导的凋亡(1)。

凋亡图像

图7.使用Click-iT TUNEL成像检测法观察晚期凋亡。HeLa细胞经斯陶洛斯波菌素处理后固定并透化。 The Click-iT TUNEL Alexa Fluor 647 Imaging Assay was performed. Activated caspase-3 was detected with a rabbit polyclonal primary antibody for cleaved caspase-3 and labeled with Alexa Fluor 488 goat anti–rabbit IgG antibody (green). 微管蛋白通过小鼠单克隆抗微管蛋白抗体检测,并用Alexa Fluor 555羊抗小鼠IgG(橙色)标记。细胞核用Hoechst 33342(蓝色)染色。浅蓝色为半胱天冬酶(绿色)、Hoechst(蓝色)和TUNEL(品红色)信号的叠加效果。

 

APO-BrdU TUNEL Assay Kit, with Alexa Fluor 488 Anti-BrdU
Basis of assayThe assay utilizes BrdU, which is incorporated at the 3’-OH ends of fragmented DNA by the TdT enzyme.
ApplicationApoptosis detection occurs via an Alexa Fluor 488 dye-labeled anti-BrdU antibody
Sample typeFixed cells
Can also be used for adherent cells
ReadoutFluorescent
LabelAlexa Fluor 488
Ex/Em (nm)490/525
Standard filter setFITC filter
Nuclear counterstainsPropidium iodide
Instrument platformFlow cytometry
Fluorescence imaging microscopy
FixationRequired
 A23210


流式细胞术用TUNEL检测

用于荧光检测的APO-BrdU TUNEL检测

Invitrogen APO-BrdU TUNEL检测试剂盒是一种用于标记DNA断裂的双色检测方法。该试剂盒已针对培养细胞的流式细胞术进行了优化,虽然也可用于在诱导凋亡后经胰酶消化的贴壁细胞。试剂盒包含碘化丙啶,用于分析总DNA含量,并提供固定的阳性和阴性对照细胞样本,以评估检测性能。该方案也可适用于荧光显微镜,但建议在抗体染色后、碘化丙啶/RNase处理前将细胞置于载玻片上。

什么是TUNEL检测?

在程序性细胞死亡(即凋亡)的晚期阶段,DNA会高度片段化。这种片段化为利用末端脱氧核苷酸转移酶dUTP缺口末端标记(TUNEL)反应将修饰的dUTP连接到受损DNA的3’-OH末端提供了机会。修饰的dUTP,如BrdUTP或EdUTP,可以通过多种不同的检测策略进行检测。针对BrdUTP的抗体可用于间接检测,而直接检测则可通过掺入生物素或荧光修饰的核苷酸(如生物素-dUTP或荧光素-dUTP)实现。dUTP的修饰形式EdUTP则通过“点击”化学反应为检测策略提供了更大的灵活性。TUNEL检测已成为检测凋亡的广泛应用的原位检测方法。


利用点击化学的TUNEL检测

Click-iT TUNEL 试剂盒

传统的 TUNEL 检测方法是通过将 BrdUTP 掺入 DNA 中,然后通过多种方式进行检测。Thermo Fisher Scientific 开发了一种改良的 TUNEL 检测方法,该方法利用末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)将炔基修饰的 dUTP(EdUTP,见图 1)掺入到断裂 DNA 的 3'-OH 末端。在 Invitrogen Click-iT TUNEL 检测中,对掺入的核苷酸的检测是通过点击化学实现的,这是一种基于铜催化叠氮-炔基环加成反应的方法,其高度特异性来源于叠氮和炔基反应对在生物分子、细胞、组织或模式生物中没有内源性存在。掺入的 EdUTP 可通过荧光或比色法进行检测。

Click-iT-EdUTP-structure-328x211

图 1. Click-iT TUNEL 成像检测试剂盒中提供的 Click-iT EdUTP 核苷酸结构。

Click-iT TUNEL 成像检测的基本步骤如图 2 所示。样本处理后,对细胞或组织进行固定和通透,以保存晚期凋亡细胞,从而减少因细胞脱落和随后的丢失而导致的假阴性结果的可能性。随后,EdUTP 核苷酸在 TdT 的作用下迅速掺入断裂的 DNA 中。下一步是连接染料或生物素叠氮,之后可选择性地加入复染剂。与采用一步法掺入染料或生物素修饰核苷酸的检测方法相比,Click-iT TUNEL 成像检测所采用的两步法,在相同条件下两小时内可检测到更高比例的凋亡细胞(见图 3)。

EdUTP 掺入 DNA 后连接染料或生物素叠氮分子,并加入可选复染剂

图2 使用 Click-iT TUNEL 成像检测检测细胞凋亡。EdUTP 由 TdT 掺入 DNA 后,连接染料或生物素叠氮,并可选择性加入复染剂。

柱状图显示使用Click-iT EdUTP衍生物检测到的阳性凋亡细胞比例最高

图3. 不同修饰型dUTP对检测到的凋亡细胞百分比的影响比较。HeLa细胞用0.5 μM的斯陶洛斯波林处理4小时。固定和透化后,按照厂家说明书分别使用Click-iT EdUTP、BrdUTP和两种不同的荧光素dUTP产品进行TUNEL成像检测。阳性百分比根据相应的阴性对照计算。成像和分析使用Thermo Fisher Scientific ArrayScan II进行。

Click-iT Plus TUNEL 检测

原始Click-iT TUNEL成像检测所涉及的检测化学反应依赖于铜的使用,我们发现生物分子对铜浓度表现出不同的敏感性。例如,用于催化点击化学反应的高铜浓度会影响与荧光蛋白(如GFP)多重检测的能力,因为蛋白的荧光会降低,或影响使用特异性结合肌动蛋白的化合物鬼笔环肽,其结合能力也会下降。为克服这些挑战,我们开发了Click-iT Plus TUNEL检测,将铜浓度优化,以在驱动检测反应的同时,保留荧光蛋白的信号并兼容鬼笔环肽的结合。

使用BrdU的TUNEL检测

APO-BrdU TUNEL检测是一种双色检测方法,用于标记DNA断裂和细胞总DNA,通过成像或流式细胞术检测凋亡细胞。Invitrogen APO-BrdU检测使用BrdU和TdT标记片段化DNA的3'-OH末端,类似于图2所述的TUNEL技术。随后使用Alexa Fluor 488标记的抗BrdU单克隆抗体检测BrdU。该检测还包括碘化丙啶,用于测定细胞总DNA含量,并提供固定的阳性和阴性对照细胞以评估检测性能。

Learn about 其他凋亡检测方法

 

TUNEL 组织检测TUNEL 培养细胞检测
Click-iT Plus TUNEL Assays for In Situ Apoptosis DetectionClick-iT TUNEL Colorimetric IHC Detection KitClick-iT TUNEL Alexa Fluor Imaging Assays for Microscopy and HCS
检测原理这些检测方法利用 EdUTP(一种经修饰的 dUTP,带有一个小的、生物正交的炔基部分),该物质会被 TdT 酶掺入到断裂 DNA 的 3’-OH 末端。
应用原位凋亡检测通过温和点击反应检测凋亡

样本类型

针对组织样本进行了优化,也可用于贴壁细胞

 

培养细胞 / 固定细胞
读出信号荧光比色法荧光

Label

Alexa Fluor 488Alexa Fluor 594Alexa Fluor 647BiotinAlexa Fluor 488Alexa Fluor 594Alexa Fluor 647
Ex/Em (nm)495/519590/615650/670N/A495/519590/615650/670
Standard filter setFITC filterTexas Red filterCy5 filterN/AFITC filterTexas Red filterCy5 filter
Instrument platformFluorescence imaging microscopy
High content analysis
Brightfield imaging microscopyImaging microscopy
High content analysis
兼容性可与GFP/鬼笔环肽多重标记可与苏木素/甲基绿多重标记使用标准荧光染料进行多重标记 不建议与荧光蛋白或鬼笔环肽进行多重标记
FixationRequired (mild fixation and permeabilization)

 

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用于组织分析的TUNEL检测

Click-iT Plus TUNEL 荧光检测法

Invitrogen Click-iT Plus TUNEL 体内凋亡检测试剂盒已针对组织切片进行了优化,尽管也可用于贴壁细胞。该基于荧光的检测方法兼容GFP及其他荧光蛋白,并可与鬼笔环肽(phalloidin)进行多重标记,如图4所示。Click-iT Plus TUNEL 检测可产生明亮、光稳定的荧光信号,并可选用Alexa Fluor 488、Alexa Fluor 594或Alexa Fluor 647叠氮试剂。

5 panel images of mouse intestinal muscle tissue section showing multiplex ability of TUNEL assay with other fluorescent probes

图4. Click-iT Plus TUNEL 检测可与多种其他荧光探针进行多重标记。来自表达GFP的小鼠肠道肌肉的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织经DNase I处理后, followed by the Click-iT Plus TUNEL Assay with Alexa Fluor 594 dye, and then stained with Hoechst 33342 dye and Alexa Fluor 647 Phalloidin. (A) 细胞核被Hoechst 33342染料(蓝色)染色,(B) 周围肌层检测到GFP信号(绿色),(C) 丝状肌动蛋白被Alexa Fluor 647鬼笔环肽(紫色)染色,(D) DNase I处理后由Click-iT Plus TUNEL检测和Alexa Fluor 594染料(红色)明确显示TUNEL阳性信号。最后一个面板(E)为四种荧光信号叠加后的多重标记图像。


Click-iT TUNEL 比色检测法

Invitrogen Click-iT TUNEL 比色IHC检测试剂盒已针对利用生物素叠氮和链霉亲和素-过氧化物酶偶联物在组织中识别凋亡细胞进行了优化,尽管也可用于贴壁细胞。在EdUTP掺入DNA断裂位点后(见图5),EdUTP被生物素叠氮标记。随后加入链霉亲和素-过氧化物酶和DAB(过氧化物酶底物)后,会产生可通过光学显微镜检测并可长期保存的深棕色信号。该检测还可与其他比色组织染色进行多重标记(见图6)。

EdUTP掺入DNA后连接生物素叠氮,链霉亲和素-过氧化物酶与生物素结合,并在加入DAB后显色的示意图

图5. Click-iT TUNEL 比色IHC检测试剂盒的实验流程. EdUTP掺入DNA后连接生物素叠氮,随后链霉亲和素-过氧化物酶与生物素结合,加入DAB后产生有色产物。
 

明场视野下的组织切片,棕色细胞核、粉色结缔组织和细胞质,以及蓝色非凋亡细胞核

图6. 小鼠组织切片使用比色Click-iT TUNEL凋亡检测法进行标记。取一张8微米的福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)小鼠胸腺切片, 使用 Click-iT TUNEL Colorimetric IHC Detection Kit 进行DAB标记以显示凋亡细胞(深棕色细胞核)。 随后用伊红Y(粉色)染色组织,再用甲基绿(蓝色)对细胞核进行复染,脱水后用Thermo Scientific Cytoseal 60封片剂进行硬封片。明场图像通过EVOS FL Auto成像系统配备的彩色相机和20倍物镜采集。

培养细胞的TUNEL检测

Invitrogen Click-iT TUNEL Alexa Fluor成像检测盒已针对高内涵筛选(HCS)和显微镜下培养细胞成像进行了优化。其小巧且特异性的标记基团使实验流程快速高效。整个检测过程可在2小时内完成,并能高效区分群体中即使是高比例的凋亡细胞。Click-iT TUNEL检测可选择不同荧光标记,支持与表面及细胞内生物标志物的多重检测。对于细胞骨架检测,我们建议使用一抗而非鬼笔环肽(见图7)。同时,不建议与荧光蛋白联合使用。该检测已在HeLa、A549和CHO K1细胞中用多种诱导凋亡的试剂(包括斯陶洛斯波菌素)进行测试,并与基于抗体的其他凋亡标志物检测(如裂解的多聚ADP核糖聚合酶(PARP)、裂解的半胱天冬酶-3和磷化组蛋白2B)进行多重检测。此外,该方法也成功检测了通过siRNA敲低DEC2转录因子在人MCF-7乳腺癌细胞中诱导的凋亡(1)。

凋亡图像

图7.使用Click-iT TUNEL成像检测法观察晚期凋亡。HeLa细胞经斯陶洛斯波菌素处理后固定并透化。 The Click-iT TUNEL Alexa Fluor 647 Imaging Assay was performed. Activated caspase-3 was detected with a rabbit polyclonal primary antibody for cleaved caspase-3 and labeled with Alexa Fluor 488 goat anti–rabbit IgG antibody (green). 微管蛋白通过小鼠单克隆抗微管蛋白抗体检测,并用Alexa Fluor 555羊抗小鼠IgG(橙色)标记。细胞核用Hoechst 33342(蓝色)染色。浅蓝色为半胱天冬酶(绿色)、Hoechst(蓝色)和TUNEL(品红色)信号的叠加效果。

 

APO-BrdU TUNEL Assay Kit, with Alexa Fluor 488 Anti-BrdU
Basis of assayThe assay utilizes BrdU, which is incorporated at the 3’-OH ends of fragmented DNA by the TdT enzyme.
ApplicationApoptosis detection occurs via an Alexa Fluor 488 dye-labeled anti-BrdU antibody
Sample typeFixed cells
Can also be used for adherent cells
ReadoutFluorescent
LabelAlexa Fluor 488
Ex/Em (nm)490/525
Standard filter setFITC filter
Nuclear counterstainsPropidium iodide
Instrument platformFlow cytometry
Fluorescence imaging microscopy
FixationRequired
 A23210


流式细胞术用TUNEL检测

用于荧光检测的APO-BrdU TUNEL检测

Invitrogen APO-BrdU TUNEL检测试剂盒是一种用于标记DNA断裂的双色检测方法。该试剂盒已针对培养细胞的流式细胞术进行了优化,虽然也可用于在诱导凋亡后经胰酶消化的贴壁细胞。试剂盒包含碘化丙啶,用于分析总DNA含量,并提供固定的阳性和阴性对照细胞样本,以评估检测性能。该方案也可适用于荧光显微镜,但建议在抗体染色后、碘化丙啶/RNase处理前将细胞置于载玻片上。


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