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基因芯片是实体瘤和血液肿瘤拷贝数变异(CNV)分析以及分子细胞遗传学研究的理想平台。Applied Biosystems CytoScan 基因芯片为高分辨率 DNA 拷贝数分析提供可靠的全基因组方法,可用于检测拷贝数增加、缺失、杂合性缺失(LOH)/杂合性缺失区域(AOH)、拷贝数中性杂合性缺失(cnLOH)、同源来源区域以及嵌合现象。
所有 CytoScan 芯片均为 hybrid-SNP 染色体基因芯片,包含大量 SNP 探针和非多态性探针。Hybrid-SNP 芯片的基因型准确率超过 99%,可提升断点判定的置信度,并在整个基因组范围内为拷贝数事件提供独立确认。
赛默飞可靠的基因芯片解决方案旨在提供可重复的结果,帮助节省时间和成本、减少错误,并交付符合实验室要求的高质量性能。
赛默飞为肿瘤临床研究提供强大的基因芯片解决方案,并配套可靠的工作流程,帮助用户轻松获得一致、可靠且高质量的结果。
我们完整的基因芯片平台 CytoScan Cytogenetics Suite 包括 hybrid-SNP 芯片、自动化和手动靶标制备选项、完整试剂套装、用于芯片处理的 GeneChip System 3000 仪器,以及用于数据解读和报告生成的 Chromosome Analysis Suite(ChAS)软件。这些工具可为实验室提供支持,帮助最大化有效运行时间。
凭借更快速度、更优覆盖度以及更低样本输入需求,CytoScan HD Accel 芯片可帮助实验室极大化提升生产力和效率。
作为被广泛应用于细胞学研究领域的选择,CytoScan HD 芯片可为肿瘤研究应用提供全基因组范围内超高分辨率的 CNV 分析。CytoScan HD 芯片的主要亮点包括:
CytoScan 750K Accel Suite 支持全面的全基因组覆盖,并可在广泛样本类型中实现出色性能,用于体质性和肿瘤研究应用中的染色体异常检测。
CytoScan 750K 可为肿瘤测试中的拷贝数增加和缺失分析提供高全基因组分辨率。CytoScan 750K 可提供:
借助 OncoScan CNV Assay 捕获关键拷贝数变化。如果您处理的是高度降解 DNA,例如来自不同保存年限 FFPE 肿瘤样本或妊娠产物(POC)的 DNA,或起始 DNA 量较低的样本(这在游离 DNA(cfDNA)中较为常见),可进一步了解为什么该 Assay 是临床研究及更多应用的自然之选。
![]() CytoScan HD Accel |
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| 研究应用 | 研究应用 | |||
| 更短周转时间和更优覆盖度,为产前和产后研究应用提供全基因组范围内超高分辨率的 CNV 分析。 | 作为被广泛应用于细胞学研究领域的选择,为产前和产后研究应用提供全基因组范围内超高分辨率的 CNV 分析。 | 通过更快周转时间和更优覆盖度,为产前、产后和肿瘤研究应用提供全基因组范围内超高分辨率的 CNV 分析。 | 为产前和产后研究中的拷贝数增加和缺失分析提供高全基因组分辨率。 | 在 FFPE 和新鲜冷冻组织中实现高分辨率分析,重点癌症基因最高可达 50 kb,全基因组范围内最高可达 300 kb。 |
| 样本类型 | 样本类型 | |||
| 血液;颊拭子;唾液;骨髓;未培养或培养细胞;绒毛膜绒毛;羊水细胞;POC | 血液、颊拭子、唾液、未培养或培养细胞、绒毛膜绒毛、羊水细胞、POC。 | 血液;颊拭子;唾液;骨髓;未培养或培养细胞;绒毛膜绒毛;羊水细胞;POC;新鲜、冷冻组织 | 血液、颊拭子、唾液、未培养或培养细胞、绒毛膜绒毛、羊水细胞、POC。 | FFPE、新鲜和冷冻组织 |
| 异常片段大小* | 异常片段大小* | |||
缺失:25 kb 增加:50 kb LOH/AOH: 3 Mb 嵌合:>15%(约) |
缺失:25 kb 增加:50 kb LOH/AOH: 3Mb 嵌合:>15%(约) |
缺失:100 kb 增加:400 kb LOH/AOH: 5 Mb 嵌合:>20% |
缺失:100 kb 增加:400 kb LOH/AOH: 5Mb 嵌合:>15%–20%(约) |
增加:50 kb 缺失:50 kb LOH/AOH: 10 Mb 嵌合(异常细胞百分比):15% |
| 输入 DNA | 输入 DNA | |||
| 100 ng | 10-250 ng** | 100 ng | 10-250 ng** | 80 ng** |
| 探针结构 | 探针结构 | |||
用于全基因组覆盖的 280 万个标记 200 万个非多态性标记 75 万个 SNP 探针,用于 LOH/AOH 分析、duo-trio 评估和样本追踪 |
用于全基因组覆盖的 267 万个标记 195 万个非多态性标记 743,000 个 SNP 探针,用于 LOH/AOH 分析、duo-trio 评估和样本追踪 |
用于全基因组覆盖的 960,755 个标记 706,054 个非多态性标记 254,701 个 SNP 探针,用于 LOH/AOH 分析、duo-trio 评估和样本追踪 |
平衡的 hybrid 双探针设计:是 平衡的全基因组覆盖:是 用于全基因组覆盖的 750,000 个标记 550,000 个非多态性标记 200,000 个 SNP 探针,用于 LOH/AOH 分析、duo-trio 评估和样本追踪 |
220,000 个分子倒置探针(MIP),覆盖全基因组 5,700 个非多态性探针 216,000 个 SNP 探针 |
| 流程 | 流程 | |||
| 2 天 | 3-4 天 | 2 天 | 3-4 天 | 2-3 天 |
*异常片段大小 — 片段判读的大小取决于该区域的平均标记间距。在标记覆盖度更高的区域可获得最优性能。嵌合检测可能取决于受影响片段的大小以及所涉及的异常类型。
**250 ng 为推荐输入量,但已有用户报告使用低至 10 ng 起始 DNA 也获得成功。
仅供科研使用。不可用于诊断程序。