探索优化的样品到富集工作流程,提升测序效率

 

随着基因组研究的规模和复杂程度不断提高,研究人员迫切需要一种外显子组测序方法,既能提供一致且高质量的数据,又不会增加不必要的时间和成本。 覆盖不均、测序脱靶、工作流程效率低下,会影响变异检测并拖慢进展;这一点,在处理有难度或高 GC 含量的区域时尤为明显。 DNA 外显子组测序依然是聚焦基因组中最具生物学意义区域的有效手段,但前提是测序的性能必须具备可预测性和可重复性。

 

Applied Biosystems 的 DNA 外显子组解决方案是一种从样品到富集的工作流程,均一性高、脱靶率低,帮助您实现高效测序,在大规模应用中也能完成可靠的变异检测。  

 

关键优势:

  • 测序效率高,数据更可信 —— 靶向捕获率良好、 覆盖均匀 且 能可靠检测  GC 含量高和复杂的区域 ,每次运行都能获得更多可调用的外显子组数据
  • 工作流程效率高,节省测序成本——优化工作流程,在相同测序能力下,每次运行可支持更多样品或更深层次测序
  • 覆盖全面,相关性高——>覆盖 99% 的主要编码数据库,针对传统上难以捕获的目标片段进行了优化,包括 SMAD4、TP53 外显子、PTEN 5' UTR 缺口和 FGFR2 区域
  • 品质保障,值得信赖——每一批次探针均经过 NGS 质量控制  

提升测序效率——从样品制备开始

我们的样品到富集 DNA 外显子组工作流程经过精心设计,力求提升文库质量,帮助您从测序运行中获得更多价值。

 

首先,根据您的样品类型和应用场景,使用 MagMAX 核酸提取试剂盒 Thermo Scientific KingFisher 样品纯化系统上制备 DNA 样品*。 接下来,利用酶促片段化和文库索引接头建立 NGS 文库,确保文库制备的一致性和可靠性*。 随后,可以通过 NGS 外显子组 DNA 检测组合、杂交试剂和捕获磁珠对目标片段进行富集,以实现外显子组的均匀覆盖。

 

富集完成后,文库即可在高通量新一代测序仪上运行,并可配合常规生物信息学工具进行分析。

 

该从样品到富集的工作流程解决方案旨在帮助您生成高质量、性能可预测的外显子组数据,让您专注于研究本身,而无需为排查工作流程故障而操心。

* 样品制备和文库制备试剂盒同样兼容全基因组测序工作流程。


覆盖均一性:双链 DNA (dsDNA) 探针的优势

Applied Biosystems NGS 捕获解决方案选用双链 DNA 探针,靶向捕获率高、能均匀地覆盖全部外显子组。 该方法能可靠地捕获高 GC 含量和复杂的区域,从而在减少测序量的同时,实现更可靠的变异检测。 此外,该工作流程经过简化、可预测,且所有探针均在制造环节接受了严格的 NGS 质量控制,所以实验室能够自信地扩大外显子组项目的规模。

 

覆盖均一性可以减少测序过多或不足的问题,让您能以更少的测序工作量获得所需的所有数据 (见图 1 和图 2)。

图 1. 均匀覆盖下的数据效率。 均一性(左侧检测组合)能获得适量的数据,实现测序的最优化,从而减少浪费;而测序不足和过多(右侧检测组合)可能会遗漏关键数据或产生多余数据,造成测序浪费。

图 2. 更好的均一性对成本的影响。 与竞品 DNA 探针对比单次运行总成本 。 我们的富集试剂盒能节省下游测序成本。

查看宣传页,了解 DNA 外显子组性能数据,包括覆盖均一性、靶向捕获率及其他指标,帮助您构建可扩展、高置信度的工作流程。
 

咨询测序工作流程专家,了解如何利用 DNA 外显子组工作流程,在优化测序费用的同时,最大限度地提升数据质量。 

订购信息

文库制备和目标片段富集产品

工作流程步骤

产品

货号

目标片段富集

NGS 外显子组 DNA 检测组合,2 次反应(8-Plex,16 个样品)

A5057745

标靶富集杂交与洗涤试剂盒(含扩增混合物),2 次反应(8-Plex,16 个样品)

A5057731

快速标靶富集杂交与洗涤试剂盒(含扩增混合物),2 次反应(8-Plex,16 个样品)

A5057773

目标片段富集通用阻滞剂,2 次反应(8-Plex,16 个样品)

A5057735

目标片段富集结合& 纯化珠(空气干燥),2 次反应(8-Plex,16 个样品)

A5057739

文库制备

酶促片段化 DNA 文库制备(含扩增混合物),16 个样品

A5057772

文库索引接头试剂盒,16 个样品

A5057704

样品制备产品取决于应用和样品类型

应用 常见的样品类型 产品 货号
血液肿瘤学 全血、骨髓 MagMAX DNA 多样品 Ultra 2.0 试剂盒 A36570
MagMAX DNA/RNA 顺序提取试剂盒

A65309

基因组学 体液、细胞、组织、唾液、拭子 MagMAX DNA 多样品 Ultra 2.0 试剂盒 A36570
MagMAX HMW DNA 试剂盒(适用于新鲜或冷冻血液,多达 100 次制备) A36626
MagMAX HMW DNA 试剂盒(适用于组织或细胞,多达 100 次制备)

A36627

实体瘤 FFPE、新鲜组织/冷冻组织 MagMAX DNA 多样品 Ultra 2.0 试剂盒 A36570
MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 试剂盒** A31881
液体活检 血浆、血清、尿液 MagMAX 游离 DNA 分离试剂盒 A29319
MagMAX 无细胞总核酸分离试剂盒 A36716

**与 AutoLys M 试管搭配使用,可实现简便脱蜡,无需使用刺激性化学溶剂


For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.