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随着基因组研究的规模和复杂程度不断提高,研究人员迫切需要一种外显子组测序方法,既能提供一致且高质量的数据,又不会增加不必要的时间和成本。 覆盖不均、测序脱靶、工作流程效率低下,会影响变异检测并拖慢进展;这一点,在处理有难度或高 GC 含量的区域时尤为明显。 DNA 外显子组测序依然是聚焦基因组中最具生物学意义区域的有效手段,但前提是测序的性能必须具备可预测性和可重复性。
Applied Biosystems 的 DNA 外显子组解决方案是一种从样品到富集的工作流程,均一性高、脱靶率低,帮助您实现高效测序,在大规模应用中也能完成可靠的变异检测。
关键优势:
我们的样品到富集 DNA 外显子组工作流程经过精心设计,力求提升文库质量,帮助您从测序运行中获得更多价值。
首先,根据您的样品类型和应用场景,使用 MagMAX 核酸提取试剂盒在 Thermo Scientific KingFisher 样品纯化系统上制备 DNA 样品*。 接下来,利用酶促片段化和文库索引接头建立 NGS 文库,确保文库制备的一致性和可靠性*。 随后,可以通过 NGS 外显子组 DNA 检测组合、杂交试剂和捕获磁珠对目标片段进行富集,以实现外显子组的均匀覆盖。
富集完成后,文库即可在高通量新一代测序仪上运行,并可配合常规生物信息学工具进行分析。
该从样品到富集的工作流程解决方案旨在帮助您生成高质量、性能可预测的外显子组数据,让您专注于研究本身,而无需为排查工作流程故障而操心。
* 样品制备和文库制备试剂盒同样兼容全基因组测序工作流程。
Applied Biosystems NGS 捕获解决方案选用双链 DNA 探针,靶向捕获率高、能均匀地覆盖全部外显子组。 该方法能可靠地捕获高 GC 含量和复杂的区域,从而在减少测序量的同时,实现更可靠的变异检测。 此外,该工作流程经过简化、可预测,且所有探针均在制造环节接受了严格的 NGS 质量控制,所以实验室能够自信地扩大外显子组项目的规模。
覆盖均一性可以减少测序过多或不足的问题,让您能以更少的测序工作量获得所需的所有数据 (见图 1 和图 2)。
图 1. 均匀覆盖下的数据效率。 均一性(左侧检测组合)能获得适量的数据,实现测序的最优化,从而减少浪费;而测序不足和过多(右侧检测组合)可能会遗漏关键数据或产生多余数据,造成测序浪费。
图 2. 更好的均一性对成本的影响。 与竞品 DNA 探针对比单次运行总成本 。 我们的富集试剂盒能节省下游测序成本。
查看宣传页,了解 DNA 外显子组性能数据,包括覆盖均一性、靶向捕获率及其他指标,帮助您构建可扩展、高置信度的工作流程。
咨询测序工作流程专家,了解如何利用 DNA 外显子组工作流程,在优化测序费用的同时,最大限度地提升数据质量。
工作流程步骤 |
产品 |
货号 |
|---|---|---|
目标片段富集 |
NGS 外显子组 DNA 检测组合,2 次反应(8-Plex,16 个样品) |
|
标靶富集杂交与洗涤试剂盒(含扩增混合物),2 次反应(8-Plex,16 个样品) |
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快速标靶富集杂交与洗涤试剂盒(含扩增混合物),2 次反应(8-Plex,16 个样品) |
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目标片段富集通用阻滞剂,2 次反应(8-Plex,16 个样品) |
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目标片段富集结合& 纯化珠(空气干燥),2 次反应(8-Plex,16 个样品) |
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文库制备 |
酶促片段化 DNA 文库制备(含扩增混合物),16 个样品 |
|
文库索引接头试剂盒,16 个样品 |
| 应用 | 常见的样品类型 | 产品 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 血液肿瘤学 | 全血、骨髓 | MagMAX DNA 多样品 Ultra 2.0 试剂盒 | A36570 |
| MagMAX DNA/RNA 顺序提取试剂盒 | |||
| 基因组学 | 体液、细胞、组织、唾液、拭子 | MagMAX DNA 多样品 Ultra 2.0 试剂盒 | A36570 |
| MagMAX HMW DNA 试剂盒(适用于新鲜或冷冻血液,多达 100 次制备) | A36626 | ||
| MagMAX HMW DNA 试剂盒(适用于组织或细胞,多达 100 次制备) | |||
| 实体瘤 | FFPE、新鲜组织/冷冻组织 | MagMAX DNA 多样品 Ultra 2.0 试剂盒 | A36570 |
| MagMAX FFPE DNA/RNA Ultra 试剂盒** | A31881 | ||
| 液体活检 | 血浆、血清、尿液 | MagMAX 游离 DNA 分离试剂盒 | A29319 |
| MagMAX 无细胞总核酸分离试剂盒 | A36716 |
**与 AutoLys M 试管搭配使用,可实现简便脱蜡,无需使用刺激性化学溶剂
For Research Use Only. Not for use in diagnostic procedures.