Cy5 excitation shown as dotted line and emission shown as solid red histogram
5633/647660/20647665(缓冲液中) 3
(抗荧光衰减时) 5		显微镜；流式细胞术；荧光微量平板读数仪

Invitrogen PE-Cyanine5 (Cy5) 染料是一种明亮的远红外荧光染料，其激发设计成配合 633 nm 或 647 nm 激光谱线使用。相对于其他荧光团，使用长波长染料 (如 Cy5 染料或 Invitrogen Alexa Fluor 647 染料) 的显著优势是生物标本在这个光谱区域中自发荧光低。Cy5 荧光团也是亲脂性神经元示踪试剂和长期 Dil 细胞示踪试剂的基础，这些试剂将烷基尾 (≥12 个碳原子) 附加到核心荧光团上。

为生成稳定信号，Alexa Fluor 647 染料 通常比蛋白质偶联物和核酸偶联物中的 Cy5 染料更明亮。别藻蓝蛋白 (APC) 是另一种在光谱上与等同于 Cy5 染料和 Alexa Fluor 647 染料的明亮荧光团，但它几乎专门用于流式细胞术。

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使用 Cy5 染料时的实验数据
zebrafish brain sample stained with green glial and orange celltracker stain

图1. 用绿色和橙色 CellTracker CM-Dil 染色剂染色的斑马鱼脑样品。免疫组织化学分析前，用 CellTracker CM-DiI 染色的 30 µm 厚斑马鱼胚胎切片。将一日龄斑马鱼胚胎固定并在后脑中以填充 95% 乙醇中 1 mg/mL CellTracker CM-DiI 的微电极刺穿。一天之后，将脑固定、包埋、冷冻于液氮中并在低温恒温器中切片。在含 2% BSA 和 2% 正常山羊血清的 PBS 中用 0.1% Triton X-100 封闭后，将 30 µm 厚切片与抗神经胶质细胞一抗联合荧光素山羊抗小鼠 IgG 抗体孵育。然后依次通过适于罗丹明和荧光素的滤光片组查看该切片，并叠加产生的图像。图像由加州理工学院贝克曼研究所 William Trevarrow 提供。

Alexa Fluor 647 has greater fluorescence compared to Cy5
图2. Alexa Fluor 647 染料抗体偶联物和 Cy5 染料抗体偶联物 (在我们实验室中制备) 的亮度比较。 更多的 Alexa Fluor 647 染料分子可与蛋白质和核酸结合，而无显著猝灭，从而产生比使用 Cy5 染料时可能明亮得多的偶联物。

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